MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli O26:H11 str. 11368 plasmid pO26_4

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014543	A	6	6	701	706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014543	ATGA	2	8	751	758	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014543	A	7	7	884	890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014543	CGC	2	6	898	903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_014543	AGC	2	6	905	910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014543	ATG	2	6	925	930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014543	T	6	6	931	936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014543	ACC	2	6	952	957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_014543	T	6	6	1004	1009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014543	AG	3	6	1021	1026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014543	CT	3	6	1050	1055	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_014543	ATT	2	6	1152	1157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014543	CTGCA	2	10	1203	1212	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_014543	ATT	2	6	1218	1223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014543	A	7	7	1257	1263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014543	CAGGA	2	10	1264	1273	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_014543	GCT	2	6	1318	1323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014543	C	6	6	1330	1335	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19	NC_014543	AAC	2	6	1356	1361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014543	GCA	2	6	1606	1611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014543	GCG	2	6	1849	1854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014543	CA	3	6	1868	1873	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_014543	CAA	2	6	1932	1937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014543	GCCGC	2	10	1957	1966	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
25	NC_014543	C	6	6	1989	1994	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
26	NC_014543	TG	3	6	2224	2229	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014543	C	6	6	2236	2241	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
28	NC_014543	GCA	2	6	2320	2325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014543	CTC	2	6	2412	2417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_014543	CCGC	2	8	2470	2477	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
31	NC_014543	T	6	6	2486	2491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014543	CAC	2	6	2538	2543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_014543	CAT	3	9	3643	3651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014543	CCA	2	6	3700	3705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_014543	A	6	6	3720	3725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014543	CA	3	6	3726	3731	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_014543	ATTTAC	2	12	3773	3784	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014543	A	6	6	3790	3795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014543	CAT	2	6	3813	3818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014543	AGC	2	6	3837	3842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014543	TAA	2	6	3873	3878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014543	TA	3	6	3882	3887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014543	ACA	2	6	3898	3903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014543	GGA	2	6	3919	3924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014543	CAA	2	6	3940	3945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014543	TGT	2	6	3991	3996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014543	ATA	2	6	4028	4033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014543	TC	3	6	4046	4051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.